較近真是好消息不斷:《FDA授予肺癌新藥dacomitinib優(yōu)先審評(píng)資格,有望成為一線治療方法》;《傳奇抗癌藥LOXO-101前沿研究數(shù)據(jù)公布:對(duì)部分癌癥治效果果對(duì)比高達(dá)93%》;《世界初次!通過來自心臟的“留言”來預(yù)防癌癥轉(zhuǎn)移》(可點(diǎn)擊厚樸方舟主頁查看相關(guān)文章)......
這幾天,又一條重磅新聞?wù)痼@了整個(gè)腫瘤界:通過對(duì)33種較常見癌癥超過11000個(gè)腫瘤樣本的分析,一份關(guān)于癌癥的“世界地圖”正式上線。這項(xiàng)凝聚了全世界無數(shù)權(quán)威腫瘤學(xué)家10多年工作的精華,發(fā)表在了27篇論文上,涵蓋權(quán)威學(xué)術(shù)期刊《細(xì)胞》及其一系列子刊。
▲前沿一期聞名學(xué)術(shù)期刊《Cell》以封面形式聚焦泛癌癥圖譜(Pan-Cancer Atlas)
該項(xiàng)目是由國(guó)立衛(wèi)生研究院(NIH)的兩個(gè)研究機(jī)構(gòu)同時(shí)贊助,即國(guó)家癌癥研究所(NCI)和國(guó)家人類基因組研究所。全美超過二十多個(gè)研究機(jī)構(gòu)的150多位研究人員參與了這項(xiàng)耗資3億美元的項(xiàng)目。
美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院院長(zhǎng)Francis S. Collins博士說:“這個(gè)項(xiàng)目是10多年來突破性工作的結(jié)晶!為癌癥研究人員提供了前所未有的工具,讓他們理解腫瘤在人體內(nèi)如何誕生、何處誕生、為何誕生,并能更好地指導(dǎo)臨床試驗(yàn),使更好的治療方法成為可能?!?/p>
具有里程碑意義的“TCGA”
不夸張地講,這個(gè)被稱為“癌癥大地圖”(Pan-Cancer Atlas)的項(xiàng)目,是癌癥研究領(lǐng)域的一大里程碑。而它的啟動(dòng)與完成,則離不開科學(xué)家們?nèi)缃橙艘话?,?xì)致地描繪出地圖的每個(gè)細(xì)節(jié)。
泛癌癥圖譜項(xiàng)目被分為三大類別,每種類別都由一篇總結(jié)性論述對(duì)其核心內(nèi)容進(jìn)行概括和引申討論,核心主題內(nèi)容包括:癌細(xì)胞起源、致癌過程和途徑以及癌細(xì)胞信號(hào)傳導(dǎo)通路等。多篇同期論文發(fā)表了對(duì)三大類別中的其他主題也進(jìn)行了深入挖掘和探討其研究成果。
在研究之初,科學(xué)家們首先依照解剖學(xué)的角度,從人體的乳腺、腎臟、肺部等不同部位分離出了腫瘤的樣本。隨后,利用多種權(quán)威的技能平臺(tái),研究人員用細(xì)胞和遺傳組成來對(duì)這些腫瘤進(jìn)行進(jìn)一步的區(qū)分。用已經(jīng)顯得有些陳舊的觀點(diǎn)看,這些腫瘤來自33種不同的部位。但根據(jù)腫瘤的分子特征,它們實(shí)際上要被重新劃分成28類。
這些分類顛覆了過去我們對(duì)腫瘤的認(rèn)知。分析結(jié)果表明,許多看似不同的癌癥,在根源上其實(shí)有著極高的相似性。舉例來說,一些帶有特定分子特征的類別,竟包括了25種(解剖學(xué)上)不同的腫瘤。這能讓研究人員的目光透過腫瘤病發(fā)部位這一表象,直擊癌癥的較初根源。
更棒的是,這些分子分析結(jié)果與大量臨床研究結(jié)合了起來,讓我們能夠理清不同的治療方法對(duì)于特定類別的癌癥,能有怎樣的效果。這些數(shù)據(jù)將對(duì)全球所有的醫(yī)生和研究人員公開。
在專家們看來,這個(gè)項(xiàng)目將直接造福于癌癥研究與癌癥新藥的開發(fā)?!斑@些前沿的成果有望讓醫(yī)藥公司開發(fā)全新的癌癥免疫治療方法方法,或是讓已經(jīng)獲批、治療其他疾病的藥物用于癌癥的治療?!奔又荽髮W(xué)舊金山分校(UCSF)的癌癥與發(fā)育治療方法項(xiàng)目主任 Christopher Benz教授評(píng)論道。
在基于癌癥基因組的分析之外,這一系列研究還綜合了癌癥轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組、甲基化組、臨床數(shù)據(jù)、以及癌癥醫(yī)學(xué)影像。通過整合不同的數(shù)據(jù)類型,研究人員們相信這可以挖掘出關(guān)鍵的洞見,帶來實(shí)際可用的信息。
“是時(shí)候重寫癌癥的教科書了!”Benz教授興奮地說道。
所有關(guān)于“泛癌癥圖譜”發(fā)表的研究成果和論文都可以通過《Cell》官網(wǎng)上獲得。此外,隨著長(zhǎng)達(dá)十年的“TCGA”項(xiàng)目的正式結(jié)題,該項(xiàng)目組牽頭機(jī)構(gòu)預(yù)期計(jì)劃舉辦一個(gè)為期3天的專題學(xué)術(shù)研討會(huì),主題是“TCGA”的豐功偉績(jī):癌癥多組學(xué)的精準(zhǔn)研究。研討會(huì)擬定2018年9月27-29日在華盛頓特區(qū)舉行。
▲泛癌癥圖譜(Pan-Cancer Atlas)的重磅文章收錄網(wǎng)站(圖片來自CellPress)
研討會(huì)屆時(shí)將著重探討癌癥研究的未來發(fā)展方向,并討論“泛癌癥圖譜”的指導(dǎo)意義,與此同時(shí),還將展示癌癥基因組結(jié)構(gòu)前沿進(jìn)展和近期靶向治療進(jìn)展等。
參考文獻(xiàn):
1. Charting a Course to a Cure
2. The Cancer Genome Atlas: CreatingLasting Value beyond Its Data
3. Cell-of-Origin Patterns Dominate theMolecular Classification of 10,000 Tumors from 33 Types of Cancer
4. Perspective on Oncogenic Processes atthe End of the Beginning of Cancer Genomics
5. Oncogenic Signaling Pathways in TheCancer Genome Atlas
6. Machine Learning Identifies StemnessFeatures Associated with Oncogenic Dedifferentiation
7. Pathogenic Germline Variants in 10,389Adult Cancers
8. Comprehensive Characterization of CancerDriver Genes and Mutations
9. A Pan-Cancer Analysis of EnhancerExpression in Nearly 9000 Patient Samples
10. An Integrated TCGA Pan-Cancer ClinicalData Resource to Drive High-Quality Survival Outcome Analytics