日本奈良先端科學技能大學院大學的特聘教授加藤菊也通過與大阪國際癌癥中心的呼吸內科和呼吸外科進行聯(lián)合研究,開發(fā)了一項高靈敏度技能,能檢測出血液中存在的微量肺癌基因發(fā)生的異常(突變)。DNA芯片研究所已于7月10日就該技能(簡稱:EGFR液體)向厚生勞動省提出審批申請。獲得批準的話即可在醫(yī)療現(xiàn)場使用。
EGFR套件的使用示意圖
吉非替尼等抑制表皮生長因子受體(EGFR)酪氨酸激酶的藥物被廣泛應用于晚期肺癌的治療,但僅在EGFR基因發(fā)生特定突變時有效,因此檢測基因突變的必要條件是選擇藥物。在日本,EGFR突變陽性肺癌約占到肺癌患者的一半,每年要實施5萬多次EGFR基因檢測。
一般來說,癌癥基因檢測需要通過活檢(采集癌組織的檢查)獲取癌組織,但有些病例進行活檢會給患者帶來很大的痛苦,而且存在侵襲身體的問題。由于癌癥患者的血液中存在由肺癌細胞釋放出來的EGFR基因,如果能對這種EGFR基因進行解析的話,就能在減輕患者負擔的情況下檢測基因突變。這種利用血液的癌癥基因檢測被稱為液體活檢,目前全球正在積極推進研發(fā)之中。
癌癥患者的血液中存在極少量來自癌細胞的游離DNA(circulating tumor DNA, ctDNA),從中可以檢測出EGFR突變。不過,由于血液中的ctDNA含量非常少,因此很難檢測出來,亟需能檢測微量突變的技能。
此次開發(fā)的技能采用新一代測序(NGS)法,能針對血液中的EGFR基因解析5萬多個分子,由此來尋找突變。因此,即使是利用傳統(tǒng)技能無法檢測到的微量突變也能檢測出來。
新一代測序技能是解析遺傳信息的強大技能,能以低成本獲得個體的全基因組序列(完整的遺傳信息)。通過僅大量(實際為5萬多個分子)解析肺癌患者血液中的EGFR基因片段(代替解析個體的全基因組)來尋找突變,即使突變頻率較低也能檢測出來。利用以往的檢查技能,必須發(fā)生5%的突變才能檢測到,而此次只要解析1萬個分子,就能檢測出0.01%的突變。
大阪國際癌癥中心在2013-2015年以288名肺癌患者為對象,比較了傳統(tǒng)的檢測方法(肺癌組織活檢)和新技能(血液檢測),得出了“完全可以用于臨床實踐”的結論。
預計該技能導入醫(yī)療機構將大大加快日本的精準醫(yī)療的發(fā)展。關于日本國內在這方面的研究,液體活檢此次實用化,采用新一代測序技能的方法是繼癌癥基因檢測系統(tǒng)“ OncoGuide? NCC Oncopanel System(國立癌癥研究中心與希森美康公司共同研發(fā))”之后第二項實現(xiàn)實用化的技能。
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