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癌癥遺傳篩選資源庫邁向新臺(tái)階,CRISPR-Cas9數(shù)據(jù)集分析更加全面!

【本文為疾病百科知識(shí),僅供閱讀】  2019-12-26  作者:厚樸方舟  

在驗(yàn)證了725種癌癥模型中跨越25種不同癌癥類型的兩個(gè)較大的CRISPR-Cas9基因篩選之后,對(duì)于癌癥生存所必需的基因的全面圖譜又近了一步?;菘瞪8裱芯克╓ellcomeSangerInstitute)和麻省理工學(xué)院和哈佛大學(xué)廣泛研究所的科學(xué)家比較了這兩個(gè)數(shù)據(jù)集的一致性,并獨(dú)立地驗(yàn)證了方法和發(fā)現(xiàn)。

該結(jié)果于今天(2019年12月20日)在《自然通訊》上發(fā)表,這意味著可以將這兩個(gè)數(shù)據(jù)集整合起來,形成迄今為止較大的癌細(xì)胞系遺傳篩選,這將為約1,000種癌癥模型中的癌癥依賴圖提供基礎(chǔ)。該組合數(shù)據(jù)集的規(guī)模將有助于加快新癌癥藥物的發(fā)現(xiàn)和開發(fā)。

癌癥遺傳篩選資源庫邁向新臺(tái)階,CRISPR-Cas9數(shù)據(jù)集分析更全面!

癌癥依賴圖(CancerDepMap)計(jì)劃旨在為患者創(chuàng)建詳細(xì)的準(zhǔn)確癌癥治療規(guī)則手冊(cè)。癌癥DepMap的兩個(gè)關(guān)鍵要素是對(duì)癌細(xì)胞存活至關(guān)重要的基因的作圖和所得數(shù)據(jù)集的分析。盡管近日癌癥研究取得了進(jìn)展,但要使準(zhǔn)確醫(yī)學(xué)廣泛用于癌癥患者仍需要許多新的藥物靶標(biāo)。

在這項(xiàng)新研究中,研究人員分析了在Broad和Sanger研究所對(duì)癌細(xì)胞系進(jìn)行的兩個(gè)近期發(fā)表的CRISPR-Cas9基因篩選的數(shù)據(jù)。盡管實(shí)驗(yàn)方案存在顯著差異,該小組發(fā)現(xiàn)篩選結(jié)果彼此一致。至關(guān)重要的是,在兩個(gè)數(shù)據(jù)集中都發(fā)現(xiàn)了對(duì)癌癥生存至關(guān)重要的相同基因(稱為依賴性)。

這項(xiàng)研究驗(yàn)證了CRISPR-Cas9功能基因篩選的可重復(fù)性,以消除對(duì)其功效的懷疑。它為評(píng)估這些新類型的數(shù)據(jù)集設(shè)定了嚴(yán)格的標(biāo)準(zhǔn),從而促進(jìn)了大型癌癥依賴數(shù)據(jù)庫的比較和集成。

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